Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxb7P09024 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxb7P09024 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxb7P09024 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxb7P09024 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxb7P09024 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxb7P09024 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxb7P09024 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxb7P09024 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxb7P09024 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxb7P09024 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxb7P09024 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxb7P09024 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxb7P09024 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxb7P09024 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxb7P09024 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxb7P09024 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxb7P09024 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxb7P09024 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxb7P09024 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxb7P09024 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxb7P09024 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxb7P09024 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxb7P09024 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxb7P09024 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxb7P09024 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxb7P09024 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxb7P09024 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxb7P09024 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxb7P09024 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxb7P09024 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxb7P09024 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxb7P09024 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxb7P09024 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxb7P09024 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxb7P09024 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxb7P09024 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxb7P09024 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxb7P09024 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxb7P09024 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxb7P09024 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxb7P09024 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms