Protein–RNA interactions for Protein: P08046

Egr1, Early growth response protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr1P08046 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Egr1P08046 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Egr1P08046 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Egr1P08046 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Egr1P08046 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Egr1P08046 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Egr1P08046 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Egr1P08046 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Egr1P08046 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Egr1P08046 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Egr1P08046 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms