Protein–RNA interactions for Protein: P05524

Fgf3, Fibroblast growth factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf3P05524 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf3P05524 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms