Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P04213 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04213 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04213 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04213 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04213 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04213 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04213 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04213 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04213 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04213 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04213 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04213 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04213 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P04213 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04213 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04213 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04213 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04213 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04213 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04213 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04213 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04213 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04213 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04213 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P04213 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P04213 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P04213 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P04213 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P04213 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P04213 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P04213 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P04213 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
P04213 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P04213 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P04213 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P04213 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P04213 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P04213 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P04213 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
P04213 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P04213 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P04213 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04213 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04213 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04213 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04213 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04213 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P04213 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04213 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04213 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P04213 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04213 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04213 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04213 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04213 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04213 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04213 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04213 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04213 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04213 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04213 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04213 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04213 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04213 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04213 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04213 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04213 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04213 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04213 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04213 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04213 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04213 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04213 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04213 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04213 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P04213 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04213 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04213 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04213 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04213 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04213 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04213 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04213 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04213 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04213 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04213 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04213 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04213 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04213 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04213 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04213 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04213 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P04213 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04213 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04213 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04213 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P04213 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P04213 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04213 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms