Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms