Protein–RNA interactions for Protein: P02340

Tp53, Cellular tumor antigen p53, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53P02340 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tp53P02340 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tp53P02340 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tp53P02340 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tp53P02340 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tp53P02340 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tp53P02340 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tp53P02340 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tp53P02340 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tp53P02340 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tp53P02340 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tp53P02340 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tp53P02340 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tp53P02340 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tp53P02340 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tp53P02340 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tp53P02340 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tp53P02340 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tp53P02340 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tp53P02340 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tp53P02340 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tp53P02340 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tp53P02340 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tp53P02340 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tp53P02340 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tp53P02340 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tp53P02340 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tp53P02340 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms