Protein–RNA interactions for Protein: P01670

Ig kappa chain V-III region PC 6684, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01670 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01670 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01670 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01670 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01670 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
P01670 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01670 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01670 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01670 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01670 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01670 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01670 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01670 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01670 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01670 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01670 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01670 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01670 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01670 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01670 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01670 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01670 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01670 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
P01670 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01670 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01670 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
P01670 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01670 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01670 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01670 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01670 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01670 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01670 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01670 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01670 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
P01670 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01670 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01670 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01670 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01670 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01670 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01670 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01670 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01670 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01670 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01670 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01670 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01670 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01670 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01670 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01670 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01670 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
P01670 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
P01670 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01670 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01670 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01670 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01670 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01670 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01670 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01670 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
P01670 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01670 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01670 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01670 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01670 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01670 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01670 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01670 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01670 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01670 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01670 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01670 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01670 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01670 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01670 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01670 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01670 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01670 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01670 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01670 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01670 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01670 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01670 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01670 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01670 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01670 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01670 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01670 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01670 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01670 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01670 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01670 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01670 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01670 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01670 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01670 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01670 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01670 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01670 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms