Protein–RNA interactions for Protein: P01653

Ig kappa chain V-V region W3082, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01653 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01653 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01653 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01653 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01653 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01653 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01653 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01653 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01653 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01653 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01653 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01653 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01653 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01653 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01653 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01653 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01653 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01653 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01653 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01653 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01653 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01653 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01653 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01653 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01653 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
P01653 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01653 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01653 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01653 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01653 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01653 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01653 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01653 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01653 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01653 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
P01653 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
P01653 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
P01653 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
P01653 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
P01653 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
P01653 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
P01653 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
P01653 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
P01653 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
P01653 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01653 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01653 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01653 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01653 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01653 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01653 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01653 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
P01653 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01653 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01653 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01653 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01653 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01653 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01653 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01653 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01653 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01653 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01653 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01653 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01653 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01653 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01653 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01653 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01653 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01653 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01653 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01653 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01653 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01653 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01653 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01653 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01653 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01653 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01653 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01653 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01653 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01653 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01653 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01653 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01653 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01653 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01653 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01653 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01653 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01653 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01653 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01653 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
P01653 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
P01653 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01653 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01653 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01653 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01653 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01653 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01653 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms