Protein–RNA interactions for Protein: P01652

Ig kappa chain V-V region J606, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01652 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01652 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01652 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01652 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01652 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01652 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01652 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01652 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01652 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01652 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01652 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01652 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01652 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01652 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01652 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01652 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01652 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01652 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01652 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01652 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01652 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01652 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01652 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01652 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01652 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01652 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01652 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01652 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01652 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01652 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01652 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01652 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01652 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01652 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01652 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01652 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01652 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01652 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
P01652 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
P01652 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01652 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01652 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01652 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01652 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01652 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01652 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01652 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01652 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01652 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01652 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01652 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01652 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01652 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01652 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
P01652 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01652 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01652 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01652 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01652 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01652 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01652 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01652 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01652 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01652 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01652 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
P01652 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01652 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01652 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
P01652 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01652 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01652 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01652 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01652 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01652 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01652 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01652 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01652 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01652 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01652 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01652 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01652 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01652 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01652 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01652 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01652 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01652 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01652 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01652 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01652 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01652 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01652 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
P01652 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01652 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01652 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01652 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01652 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01652 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01652 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01652 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01652 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms