Protein–RNA interactions for Protein: P01629

Ig kappa chain V-II region 2S1.3, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01629 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01629 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01629 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01629 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01629 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01629 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01629 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01629 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01629 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01629 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01629 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01629 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01629 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01629 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01629 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01629 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01629 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01629 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01629 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01629 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01629 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01629 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01629 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01629 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01629 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01629 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01629 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01629 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01629 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01629 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01629 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01629 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01629 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01629 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01629 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01629 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01629 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01629 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01629 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01629 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01629 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01629 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01629 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01629 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01629 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01629 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01629 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01629 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01629 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01629 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01629 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01629 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01629 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01629 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01629 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01629 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01629 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01629 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01629 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01629 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01629 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01629 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01629 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01629 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01629 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01629 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01629 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01629 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01629 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01629 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01629 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01629 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01629 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01629 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01629 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01629 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01629 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01629 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01629 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01629 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01629 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01629 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01629 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01629 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01629 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01629 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01629 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01629 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01629 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01629 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01629 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01629 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01629 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01629 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01629 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01629 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01629 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01629 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01629 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01629 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms