Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifnb1P01575 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifnb1P01575 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifnb1P01575 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifnb1P01575 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifnb1P01575 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifnb1P01575 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifnb1P01575 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifnb1P01575 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifnb1P01575 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifnb1P01575 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifnb1P01575 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifnb1P01575 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifnb1P01575 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifnb1P01575 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifnb1P01575 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifnb1P01575 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifnb1P01575 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifnb1P01575 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifnb1P01575 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifnb1P01575 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifnb1P01575 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifnb1P01575 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifnb1P01575 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifnb1P01575 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifnb1P01575 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifnb1P01575 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifnb1P01575 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifnb1P01575 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifnb1P01575 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifnb1P01575 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifnb1P01575 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifnb1P01575 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifnb1P01575 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifnb1P01575 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifnb1P01575 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifnb1P01575 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifnb1P01575 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifnb1P01575 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifnb1P01575 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifnb1P01575 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifnb1P01575 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifnb1P01575 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifnb1P01575 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifnb1P01575 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifnb1P01575 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifnb1P01575 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifnb1P01575 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifnb1P01575 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifnb1P01575 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifnb1P01575 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifnb1P01575 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifnb1P01575 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifnb1P01575 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifnb1P01575 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifnb1P01575 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifnb1P01575 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifnb1P01575 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifnb1P01575 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifnb1P01575 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifnb1P01575 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifnb1P01575 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifnb1P01575 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ifnb1P01575 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ifnb1P01575 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ifnb1P01575 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ifnb1P01575 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ifnb1P01575 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ifnb1P01575 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifnb1P01575 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms