Protein–RNA interactions for Protein: O89116

Vti1a, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1aO89116 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vti1aO89116 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vti1aO89116 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vti1aO89116 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vti1aO89116 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vti1aO89116 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vti1aO89116 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vti1aO89116 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vti1aO89116 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vti1aO89116 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vti1aO89116 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vti1aO89116 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vti1aO89116 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vti1aO89116 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vti1aO89116 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vti1aO89116 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vti1aO89116 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vti1aO89116 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vti1aO89116 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vti1aO89116 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Vti1aO89116 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vti1aO89116 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vti1aO89116 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vti1aO89116 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vti1aO89116 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vti1aO89116 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vti1aO89116 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vti1aO89116 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vti1aO89116 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vti1aO89116 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vti1aO89116 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vti1aO89116 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vti1aO89116 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vti1aO89116 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vti1aO89116 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vti1aO89116 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vti1aO89116 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vti1aO89116 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vti1aO89116 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vti1aO89116 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vti1aO89116 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vti1aO89116 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vti1aO89116 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vti1aO89116 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Vti1aO89116 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Vti1aO89116 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Vti1aO89116 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Vti1aO89116 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Vti1aO89116 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vti1aO89116 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vti1aO89116 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vti1aO89116 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vti1aO89116 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vti1aO89116 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vti1aO89116 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vti1aO89116 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vti1aO89116 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vti1aO89116 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vti1aO89116 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vti1aO89116 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vti1aO89116 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vti1aO89116 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vti1aO89116 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vti1aO89116 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vti1aO89116 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vti1aO89116 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vti1aO89116 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vti1aO89116 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vti1aO89116 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vti1aO89116 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vti1aO89116 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vti1aO89116 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vti1aO89116 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vti1aO89116 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vti1aO89116 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vti1aO89116 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vti1aO89116 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vti1aO89116 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vti1aO89116 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vti1aO89116 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vti1aO89116 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vti1aO89116 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vti1aO89116 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vti1aO89116 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vti1aO89116 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vti1aO89116 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Vti1aO89116 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vti1aO89116 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vti1aO89116 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vti1aO89116 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vti1aO89116 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vti1aO89116 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vti1aO89116 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Vti1aO89116 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vti1aO89116 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vti1aO89116 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vti1aO89116 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vti1aO89116 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vti1aO89116 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vti1aO89116 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms