Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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