Protein–RNA interactions for Protein: O88870

Best1, Bestrophin-1, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best1O88870 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Best1O88870 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Best1O88870 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Best1O88870 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Best1O88870 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Best1O88870 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Best1O88870 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Best1O88870 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Best1O88870 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Best1O88870 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Best1O88870 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Best1O88870 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Best1O88870 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Best1O88870 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Best1O88870 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Best1O88870 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Best1O88870 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Best1O88870 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Best1O88870 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Best1O88870 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Best1O88870 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Best1O88870 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Best1O88870 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Best1O88870 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Best1O88870 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Best1O88870 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Best1O88870 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Best1O88870 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Best1O88870 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Best1O88870 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Best1O88870 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Best1O88870 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Best1O88870 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Best1O88870 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Best1O88870 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Best1O88870 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Best1O88870 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Best1O88870 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Best1O88870 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Best1O88870 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Best1O88870 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Best1O88870 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Best1O88870 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Best1O88870 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Best1O88870 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Best1O88870 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Best1O88870 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Best1O88870 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Best1O88870 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Best1O88870 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Best1O88870 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Best1O88870 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Best1O88870 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Best1O88870 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Best1O88870 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Best1O88870 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Best1O88870 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Best1O88870 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Best1O88870 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Best1O88870 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Best1O88870 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Best1O88870 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Best1O88870 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Best1O88870 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Best1O88870 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Best1O88870 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Best1O88870 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Best1O88870 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Best1O88870 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Best1O88870 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Best1O88870 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Best1O88870 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Best1O88870 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Best1O88870 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Best1O88870 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Best1O88870 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Best1O88870 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Best1O88870 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Best1O88870 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Best1O88870 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Best1O88870 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Best1O88870 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Best1O88870 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Best1O88870 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Best1O88870 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Best1O88870 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Best1O88870 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Best1O88870 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Best1O88870 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Best1O88870 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Best1O88870 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Best1O88870 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Best1O88870 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Best1O88870 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Best1O88870 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Best1O88870 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Best1O88870 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Best1O88870 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Best1O88870 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Best1O88870 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms