Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BlmO88700 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BlmO88700 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BlmO88700 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BlmO88700 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BlmO88700 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BlmO88700 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BlmO88700 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BlmO88700 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BlmO88700 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BlmO88700 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BlmO88700 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BlmO88700 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BlmO88700 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BlmO88700 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BlmO88700 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BlmO88700 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BlmO88700 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BlmO88700 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BlmO88700 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BlmO88700 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BlmO88700 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BlmO88700 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BlmO88700 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BlmO88700 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BlmO88700 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
BlmO88700 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BlmO88700 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
BlmO88700 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BlmO88700 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BlmO88700 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BlmO88700 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BlmO88700 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
BlmO88700 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BlmO88700 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BlmO88700 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BlmO88700 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BlmO88700 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BlmO88700 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BlmO88700 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BlmO88700 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BlmO88700 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
BlmO88700 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BlmO88700 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BlmO88700 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BlmO88700 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BlmO88700 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BlmO88700 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BlmO88700 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BlmO88700 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
BlmO88700 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BlmO88700 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
BlmO88700 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BlmO88700 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BlmO88700 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
BlmO88700 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BlmO88700 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BlmO88700 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BlmO88700 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BlmO88700 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BlmO88700 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BlmO88700 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BlmO88700 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BlmO88700 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BlmO88700 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BlmO88700 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BlmO88700 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BlmO88700 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
BlmO88700 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BlmO88700 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BlmO88700 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BlmO88700 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BlmO88700 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BlmO88700 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BlmO88700 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BlmO88700 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BlmO88700 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BlmO88700 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BlmO88700 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BlmO88700 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BlmO88700 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BlmO88700 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BlmO88700 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BlmO88700 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BlmO88700 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BlmO88700 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
BlmO88700 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
BlmO88700 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BlmO88700 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
BlmO88700 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BlmO88700 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BlmO88700 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BlmO88700 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BlmO88700 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
BlmO88700 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BlmO88700 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BlmO88700 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BlmO88700 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BlmO88700 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BlmO88700 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms