Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dnmt3bO88509 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms