Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CntfrO88507 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CntfrO88507 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CntfrO88507 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CntfrO88507 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CntfrO88507 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CntfrO88507 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfrO88507 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CntfrO88507 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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