Protein–RNA interactions for Protein: O88456

Capns1, Calpain small subunit 1, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns1O88456 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capns1O88456 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capns1O88456 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capns1O88456 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capns1O88456 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capns1O88456 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capns1O88456 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capns1O88456 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Capns1O88456 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capns1O88456 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capns1O88456 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capns1O88456 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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