Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnnal1O88327 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms