Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Col5a1O88207 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Col5a1O88207 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Col5a1O88207 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Col5a1O88207 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Col5a1O88207 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Col5a1O88207 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col5a1O88207 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
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Col5a1O88207 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
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