Protein–RNA interactions for Protein: O70496

Clcn7, H(+)/Cl(-) exchange transporter 7, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn7O70496 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clcn7O70496 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clcn7O70496 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcn7O70496 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcn7O70496 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcn7O70496 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcn7O70496 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcn7O70496 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcn7O70496 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcn7O70496 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcn7O70496 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcn7O70496 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcn7O70496 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcn7O70496 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcn7O70496 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcn7O70496 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcn7O70496 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcn7O70496 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcn7O70496 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcn7O70496 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcn7O70496 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcn7O70496 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcn7O70496 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcn7O70496 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcn7O70496 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcn7O70496 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clcn7O70496 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clcn7O70496 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clcn7O70496 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clcn7O70496 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clcn7O70496 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcn7O70496 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcn7O70496 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcn7O70496 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcn7O70496 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcn7O70496 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcn7O70496 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcn7O70496 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcn7O70496 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcn7O70496 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcn7O70496 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcn7O70496 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcn7O70496 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcn7O70496 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcn7O70496 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcn7O70496 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcn7O70496 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcn7O70496 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcn7O70496 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcn7O70496 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcn7O70496 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcn7O70496 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcn7O70496 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcn7O70496 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcn7O70496 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcn7O70496 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcn7O70496 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcn7O70496 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcn7O70496 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcn7O70496 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcn7O70496 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcn7O70496 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcn7O70496 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcn7O70496 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcn7O70496 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcn7O70496 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcn7O70496 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcn7O70496 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcn7O70496 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcn7O70496 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcn7O70496 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcn7O70496 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcn7O70496 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcn7O70496 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcn7O70496 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcn7O70496 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcn7O70496 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcn7O70496 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcn7O70496 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcn7O70496 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcn7O70496 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcn7O70496 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcn7O70496 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcn7O70496 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcn7O70496 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcn7O70496 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcn7O70496 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcn7O70496 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcn7O70496 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcn7O70496 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clcn7O70496 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clcn7O70496 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clcn7O70496 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clcn7O70496 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clcn7O70496 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clcn7O70496 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Clcn7O70496 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clcn7O70496 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clcn7O70496 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clcn7O70496 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms