Protein–RNA interactions for Protein: O55237

Cd70, CD70 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd70O55237 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd70O55237 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd70O55237 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd70O55237 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd70O55237 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd70O55237 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd70O55237 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd70O55237 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd70O55237 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd70O55237 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd70O55237 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd70O55237 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd70O55237 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms