Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChkbO55229 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChkbO55229 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChkbO55229 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChkbO55229 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChkbO55229 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms