Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Supt5hO55201 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Supt5hO55201 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms