Protein–RNA interactions for Protein: O55128

Sap18, Histone deacetylase complex subunit SAP18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap18O55128 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sap18O55128 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sap18O55128 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sap18O55128 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sap18O55128 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sap18O55128 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Sap18O55128 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Sap18O55128 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sap18O55128 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Sap18O55128 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sap18O55128 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sap18O55128 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sap18O55128 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sap18O55128 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sap18O55128 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sap18O55128 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sap18O55128 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sap18O55128 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sap18O55128 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sap18O55128 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sap18O55128 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sap18O55128 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sap18O55128 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sap18O55128 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sap18O55128 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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