Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms