Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn20O55082 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn20O55082 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn20O55082 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn20O55082 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn20O55082 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn20O55082 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn20O55082 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn20O55082 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn20O55082 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn20O55082 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn20O55082 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn20O55082 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn20O55082 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn20O55082 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn20O55082 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn20O55082 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn20O55082 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn20O55082 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn20O55082 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn20O55082 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn20O55082 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn20O55082 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn20O55082 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn20O55082 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn20O55082 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn20O55082 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn20O55082 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn20O55082 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn20O55082 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn20O55082 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn20O55082 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn20O55082 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn20O55082 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn20O55082 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn20O55082 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn20O55082 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn20O55082 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn20O55082 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn20O55082 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn20O55082 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn20O55082 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn20O55082 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn20O55082 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn20O55082 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn20O55082 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn20O55082 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn20O55082 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn20O55082 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn20O55082 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn20O55082 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn20O55082 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn20O55082 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn20O55082 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn20O55082 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn20O55082 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn20O55082 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn20O55082 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn20O55082 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn20O55082 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms