Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Copb2O55029 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Copb2O55029 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Copb2O55029 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Copb2O55029 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Copb2O55029 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Copb2O55029 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Copb2O55029 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms