Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms