Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Stag2O35638 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stag2O35638 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stag2O35638 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stag2O35638 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stag2O35638 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms