Protein–RNA interactions for Protein: O35473

C1d, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1dO35473 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1dO35473 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1dO35473 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1dO35473 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1dO35473 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1dO35473 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1dO35473 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1dO35473 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1dO35473 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1dO35473 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1dO35473 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1dO35473 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1dO35473 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1dO35473 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1dO35473 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1dO35473 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1dO35473 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1dO35473 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C1dO35473 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1dO35473 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1dO35473 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1dO35473 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1dO35473 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1dO35473 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1dO35473 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1dO35473 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1dO35473 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1dO35473 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1dO35473 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1dO35473 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1dO35473 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1dO35473 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1dO35473 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1dO35473 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1dO35473 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1dO35473 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1dO35473 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C1dO35473 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1dO35473 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1dO35473 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1dO35473 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1dO35473 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1dO35473 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1dO35473 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1dO35473 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1dO35473 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1dO35473 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1dO35473 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1dO35473 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1dO35473 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1dO35473 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1dO35473 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1dO35473 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1dO35473 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1dO35473 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1dO35473 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1dO35473 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1dO35473 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1dO35473 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1dO35473 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1dO35473 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1dO35473 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1dO35473 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1dO35473 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1dO35473 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1dO35473 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1dO35473 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1dO35473 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1dO35473 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1dO35473 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1dO35473 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1dO35473 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1dO35473 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1dO35473 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1dO35473 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1dO35473 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1dO35473 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1dO35473 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1dO35473 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1dO35473 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1dO35473 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1dO35473 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1dO35473 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1dO35473 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1dO35473 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1dO35473 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1dO35473 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1dO35473 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1dO35473 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1dO35473 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1dO35473 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1dO35473 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1dO35473 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1dO35473 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1dO35473 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1dO35473 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1dO35473 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1dO35473 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1dO35473 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1dO35473 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms