Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema6aO35464 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms