Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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