Protein–RNA interactions for Protein: O35372

Cnih1, Protein cornichon homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih1O35372 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnih1O35372 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnih1O35372 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnih1O35372 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnih1O35372 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnih1O35372 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnih1O35372 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnih1O35372 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnih1O35372 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnih1O35372 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnih1O35372 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnih1O35372 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnih1O35372 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnih1O35372 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnih1O35372 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnih1O35372 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnih1O35372 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnih1O35372 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnih1O35372 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnih1O35372 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnih1O35372 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnih1O35372 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnih1O35372 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnih1O35372 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnih1O35372 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnih1O35372 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnih1O35372 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnih1O35372 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Cnih1O35372 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms