Protein–RNA interactions for Protein: O35345

Kpna6, Importin subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna6O35345 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kpna6O35345 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Kpna6O35345 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Kpna6O35345 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms