Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kpna3O35344 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms