Protein–RNA interactions for Protein: O35343

Kpna4, Importin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna4O35343 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kpna4O35343 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kpna4O35343 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kpna4O35343 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kpna4O35343 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kpna4O35343 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kpna4O35343 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kpna4O35343 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kpna4O35343 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kpna4O35343 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kpna4O35343 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kpna4O35343 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Kpna4O35343 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kpna4O35343 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kpna4O35343 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kpna4O35343 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kpna4O35343 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kpna4O35343 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kpna4O35343 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Kpna4O35343 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kpna4O35343 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Kpna4O35343 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kpna4O35343 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kpna4O35343 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kpna4O35343 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kpna4O35343 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kpna4O35343 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kpna4O35343 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kpna4O35343 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kpna4O35343 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kpna4O35343 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kpna4O35343 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Kpna4O35343 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kpna4O35343 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kpna4O35343 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kpna4O35343 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kpna4O35343 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kpna4O35343 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kpna4O35343 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kpna4O35343 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kpna4O35343 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kpna4O35343 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kpna4O35343 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kpna4O35343 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Kpna4O35343 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kpna4O35343 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kpna4O35343 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kpna4O35343 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kpna4O35343 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kpna4O35343 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kpna4O35343 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kpna4O35343 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kpna4O35343 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kpna4O35343 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kpna4O35343 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kpna4O35343 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kpna4O35343 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kpna4O35343 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kpna4O35343 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kpna4O35343 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kpna4O35343 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Kpna4O35343 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kpna4O35343 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kpna4O35343 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kpna4O35343 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kpna4O35343 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kpna4O35343 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kpna4O35343 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kpna4O35343 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms