Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms