Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Kcns1O35173 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Kcns1O35173 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Kcns1O35173 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Kcns1O35173 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Kcns1O35173 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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