Protein–RNA interactions for Protein: O35125

Lrrc23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc23O35125 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc23O35125 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc23O35125 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc23O35125 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc23O35125 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc23O35125 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc23O35125 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc23O35125 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc23O35125 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc23O35125 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc23O35125 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc23O35125 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc23O35125 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc23O35125 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc23O35125 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc23O35125 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc23O35125 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc23O35125 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc23O35125 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc23O35125 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc23O35125 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc23O35125 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc23O35125 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc23O35125 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc23O35125 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc23O35125 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc23O35125 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc23O35125 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc23O35125 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc23O35125 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc23O35125 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc23O35125 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc23O35125 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc23O35125 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc23O35125 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc23O35125 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc23O35125 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc23O35125 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc23O35125 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc23O35125 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc23O35125 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc23O35125 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc23O35125 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc23O35125 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc23O35125 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc23O35125 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc23O35125 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc23O35125 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc23O35125 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc23O35125 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc23O35125 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc23O35125 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc23O35125 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc23O35125 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc23O35125 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc23O35125 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc23O35125 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc23O35125 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc23O35125 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc23O35125 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc23O35125 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc23O35125 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc23O35125 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc23O35125 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc23O35125 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc23O35125 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc23O35125 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc23O35125 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc23O35125 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Lrrc23O35125 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc23O35125 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc23O35125 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc23O35125 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc23O35125 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc23O35125 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Lrrc23O35125 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc23O35125 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc23O35125 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc23O35125 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc23O35125 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc23O35125 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc23O35125 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc23O35125 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc23O35125 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc23O35125 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc23O35125 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc23O35125 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc23O35125 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc23O35125 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc23O35125 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc23O35125 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc23O35125 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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Lrrc23O35125 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Lrrc23O35125 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc23O35125 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms