Protein–RNA interactions for Protein: O35089

Cnih2, Protein cornichon homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih2O35089 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnih2O35089 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnih2O35089 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms