Protein–RNA interactions for Protein: O35071

Kif1c, Kinesin-like protein KIF1C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif1cO35071 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif1cO35071 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms