Protein–RNA interactions for Protein: O09172

Gclm, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GclmO09172 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GclmO09172 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GclmO09172 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GclmO09172 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GclmO09172 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GclmO09172 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GclmO09172 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GclmO09172 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GclmO09172 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GclmO09172 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GclmO09172 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GclmO09172 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GclmO09172 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GclmO09172 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GclmO09172 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GclmO09172 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GclmO09172 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GclmO09172 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GclmO09172 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GclmO09172 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GclmO09172 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GclmO09172 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GclmO09172 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GclmO09172 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GclmO09172 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GclmO09172 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GclmO09172 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GclmO09172 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GclmO09172 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GclmO09172 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GclmO09172 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GclmO09172 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GclmO09172 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GclmO09172 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GclmO09172 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GclmO09172 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GclmO09172 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GclmO09172 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GclmO09172 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GclmO09172 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GclmO09172 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GclmO09172 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GclmO09172 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GclmO09172 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GclmO09172 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GclmO09172 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GclmO09172 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GclmO09172 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GclmO09172 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GclmO09172 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GclmO09172 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GclmO09172 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GclmO09172 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GclmO09172 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GclmO09172 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GclmO09172 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GclmO09172 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GclmO09172 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GclmO09172 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GclmO09172 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GclmO09172 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GclmO09172 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GclmO09172 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GclmO09172 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GclmO09172 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GclmO09172 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GclmO09172 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GclmO09172 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GclmO09172 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GclmO09172 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GclmO09172 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GclmO09172 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GclmO09172 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GclmO09172 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GclmO09172 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GclmO09172 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GclmO09172 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GclmO09172 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GclmO09172 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GclmO09172 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GclmO09172 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GclmO09172 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GclmO09172 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GclmO09172 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GclmO09172 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GclmO09172 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GclmO09172 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GclmO09172 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GclmO09172 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GclmO09172 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GclmO09172 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GclmO09172 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GclmO09172 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GclmO09172 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GclmO09172 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GclmO09172 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GclmO09172 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GclmO09172 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GclmO09172 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GclmO09172 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms