Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gfra2O08842 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gfra2O08842 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gfra2O08842 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gfra2O08842 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gfra2O08842 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gfra2O08842 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gfra2O08842 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gfra2O08842 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gfra2O08842 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gfra2O08842 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gfra2O08842 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gfra2O08842 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gfra2O08842 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gfra2O08842 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gfra2O08842 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gfra2O08842 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gfra2O08842 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gfra2O08842 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gfra2O08842 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gfra2O08842 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gfra2O08842 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfra2O08842 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfra2O08842 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfra2O08842 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfra2O08842 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfra2O08842 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfra2O08842 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfra2O08842 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfra2O08842 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfra2O08842 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfra2O08842 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfra2O08842 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfra2O08842 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfra2O08842 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfra2O08842 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfra2O08842 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gfra2O08842 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gfra2O08842 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gfra2O08842 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gfra2O08842 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gfra2O08842 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gfra2O08842 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gfra2O08842 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gfra2O08842 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gfra2O08842 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gfra2O08842 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gfra2O08842 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gfra2O08842 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gfra2O08842 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gfra2O08842 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gfra2O08842 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gfra2O08842 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gfra2O08842 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gfra2O08842 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gfra2O08842 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gfra2O08842 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gfra2O08842 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gfra2O08842 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gfra2O08842 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gfra2O08842 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfra2O08842 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfra2O08842 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfra2O08842 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfra2O08842 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfra2O08842 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfra2O08842 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfra2O08842 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfra2O08842 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfra2O08842 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfra2O08842 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfra2O08842 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfra2O08842 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfra2O08842 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfra2O08842 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfra2O08842 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfra2O08842 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfra2O08842 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfra2O08842 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfra2O08842 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfra2O08842 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfra2O08842 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfra2O08842 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfra2O08842 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfra2O08842 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfra2O08842 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfra2O08842 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfra2O08842 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfra2O08842 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfra2O08842 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfra2O08842 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfra2O08842 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfra2O08842 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfra2O08842 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfra2O08842 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfra2O08842 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfra2O08842 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfra2O08842 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfra2O08842 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfra2O08842 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms