Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CckarO08786 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CckarO08786 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CckarO08786 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CckarO08786 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CckarO08786 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CckarO08786 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CckarO08786 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CckarO08786 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CckarO08786 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CckarO08786 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CckarO08786 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CckarO08786 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CckarO08786 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CckarO08786 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CckarO08786 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CckarO08786 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CckarO08786 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CckarO08786 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CckarO08786 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CckarO08786 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CckarO08786 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CckarO08786 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CckarO08786 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CckarO08786 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CckarO08786 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CckarO08786 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CckarO08786 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CckarO08786 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CckarO08786 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CckarO08786 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CckarO08786 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CckarO08786 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CckarO08786 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CckarO08786 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CckarO08786 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CckarO08786 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CckarO08786 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CckarO08786 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CckarO08786 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CckarO08786 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CckarO08786 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CckarO08786 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CckarO08786 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CckarO08786 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CckarO08786 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CckarO08786 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CckarO08786 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CckarO08786 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CckarO08786 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CckarO08786 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CckarO08786 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CckarO08786 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CckarO08786 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CckarO08786 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CckarO08786 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CckarO08786 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CckarO08786 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CckarO08786 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CckarO08786 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CckarO08786 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CckarO08786 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CckarO08786 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CckarO08786 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CckarO08786 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CckarO08786 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CckarO08786 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CckarO08786 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CckarO08786 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CckarO08786 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CckarO08786 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CckarO08786 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CckarO08786 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CckarO08786 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CckarO08786 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CckarO08786 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CckarO08786 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CckarO08786 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CckarO08786 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CckarO08786 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CckarO08786 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CckarO08786 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CckarO08786 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CckarO08786 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CckarO08786 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CckarO08786 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CckarO08786 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CckarO08786 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CckarO08786 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CckarO08786 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CckarO08786 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CckarO08786 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CckarO08786 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CckarO08786 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CckarO08786 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CckarO08786 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CckarO08786 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CckarO08786 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CckarO08786 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CckarO08786 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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