Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MsmbO08540 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MsmbO08540 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MsmbO08540 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MsmbO08540 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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