Protein–RNA interactions for Protein: L7N248

Gm6871, Predicted gene 6871, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6871L7N248 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Gm6871L7N248 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Gm6871L7N248 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Gm6871L7N248 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Gm6871L7N248 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Gm6871L7N248 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Gm6871L7N248 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Gm6871L7N248 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Gm6871L7N248 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
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Gm6871L7N248 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm6871L7N248 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm6871L7N248 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm6871L7N248 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm6871L7N248 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm6871L7N248 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm6871L7N248 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm6871L7N248 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm6871L7N248 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm6871L7N248 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm6871L7N248 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm6871L7N248 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm6871L7N248 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm6871L7N248 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm6871L7N248 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm6871L7N248 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm6871L7N248 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm6871L7N248 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm6871L7N248 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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