Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
IfnabL7MTU6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms