Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3542K7N6U2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3542K7N6U2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3542K7N6U2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3542K7N6U2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3542K7N6U2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3542K7N6U2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3542K7N6U2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3542K7N6U2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3542K7N6U2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3542K7N6U2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3542K7N6U2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3542K7N6U2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3542K7N6U2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3542K7N6U2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3542K7N6U2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3542K7N6U2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3542K7N6U2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3542K7N6U2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3542K7N6U2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3542K7N6U2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3542K7N6U2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3542K7N6U2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3542K7N6U2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3542K7N6U2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3542K7N6U2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3542K7N6U2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3542K7N6U2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3542K7N6U2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3542K7N6U2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3542K7N6U2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3542K7N6U2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3542K7N6U2 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3542K7N6U2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3542K7N6U2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3542K7N6U2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3542K7N6U2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3542K7N6U2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3542K7N6U2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3542K7N6U2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3542K7N6U2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3542K7N6U2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3542K7N6U2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3542K7N6U2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm3542K7N6U2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm3542K7N6U2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm3542K7N6U2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3542K7N6U2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3542K7N6U2 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3542K7N6U2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3542K7N6U2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3542K7N6U2 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3542K7N6U2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3542K7N6U2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3542K7N6U2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3542K7N6U2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3542K7N6U2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3542K7N6U2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3542K7N6U2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3542K7N6U2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3542K7N6U2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3542K7N6U2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3542K7N6U2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3542K7N6U2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3542K7N6U2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3542K7N6U2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3542K7N6U2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3542K7N6U2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3542K7N6U2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3542K7N6U2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3542K7N6U2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3542K7N6U2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3542K7N6U2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3542K7N6U2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3542K7N6U2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3542K7N6U2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3542K7N6U2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3542K7N6U2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3542K7N6U2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3542K7N6U2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3542K7N6U2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3542K7N6U2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3542K7N6U2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3542K7N6U2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3542K7N6U2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3542K7N6U2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3542K7N6U2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3542K7N6U2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3542K7N6U2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3542K7N6U2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3542K7N6U2 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3542K7N6U2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3542K7N6U2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3542K7N6U2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3542K7N6U2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3542K7N6U2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3542K7N6U2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3542K7N6U2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3542K7N6U2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3542K7N6U2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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