Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ27

Ccdc191, Coiled-coil domain-containing 191, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc191J3QQ27 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc191J3QQ27 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc191J3QQ27 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc191J3QQ27 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc191J3QQ27 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc191J3QQ27 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc191J3QQ27 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc191J3QQ27 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc191J3QQ27 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc191J3QQ27 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc191J3QQ27 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc191J3QQ27 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc191J3QQ27 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc191J3QQ27 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc191J3QQ27 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc191J3QQ27 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc191J3QQ27 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc191J3QQ27 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc191J3QQ27 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc191J3QQ27 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc191J3QQ27 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc191J3QQ27 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc191J3QQ27 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc191J3QQ27 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc191J3QQ27 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc191J3QQ27 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc191J3QQ27 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc191J3QQ27 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc191J3QQ27 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc191J3QQ27 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc191J3QQ27 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc191J3QQ27 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc191J3QQ27 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc191J3QQ27 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc191J3QQ27 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc191J3QQ27 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc191J3QQ27 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc191J3QQ27 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc191J3QQ27 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc191J3QQ27 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc191J3QQ27 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc191J3QQ27 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc191J3QQ27 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc191J3QQ27 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc191J3QQ27 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc191J3QQ27 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc191J3QQ27 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc191J3QQ27 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc191J3QQ27 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc191J3QQ27 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc191J3QQ27 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc191J3QQ27 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc191J3QQ27 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc191J3QQ27 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc191J3QQ27 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc191J3QQ27 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc191J3QQ27 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc191J3QQ27 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc191J3QQ27 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc191J3QQ27 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc191J3QQ27 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc191J3QQ27 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc191J3QQ27 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc191J3QQ27 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc191J3QQ27 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc191J3QQ27 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc191J3QQ27 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc191J3QQ27 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc191J3QQ27 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc191J3QQ27 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc191J3QQ27 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc191J3QQ27 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc191J3QQ27 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc191J3QQ27 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc191J3QQ27 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc191J3QQ27 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc191J3QQ27 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc191J3QQ27 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc191J3QQ27 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc191J3QQ27 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc191J3QQ27 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc191J3QQ27 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc191J3QQ27 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc191J3QQ27 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc191J3QQ27 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc191J3QQ27 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc191J3QQ27 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc191J3QQ27 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc191J3QQ27 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc191J3QQ27 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc191J3QQ27 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc191J3QQ27 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc191J3QQ27 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc191J3QQ27 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc191J3QQ27 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc191J3QQ27 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc191J3QQ27 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc191J3QQ27 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc191J3QQ27 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc191J3QQ27 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms